Ученые компании Abbott идентифицировали новый субтип вируса иммунодефицита человека (ВИЧ), названный ВИЧ-1 Группа М, субтип L. Первый за 19 лет новый субтип вируса был найден путем секвенирования генома нового поколения.
Вирусы группы М являются основной группой ВИЧ, которая повлекла за собой глобальную пандемию и которая прослеживается в Демократической Республике Конго (ДРК), в странах Африки южнее Сахары. Для того чтобы определить, является ли необычный вирус новым субтипом ВИЧ, необходимо зафиксировать три независимых друг от друга случая. Первые два образца этого субтипа были обнаружены в ДРК в 1980-х и 1990-х годах. Третий, полученный в 2001 году, было трудно секвенировать по причине большого количества вирусов в образце и существующих на тот момент технологий.
Сегодня технология секвенирования нового поколения позволяет исследователям создавать целый геном на более высоких скоростях и с меньшими затратами. Для того чтобы использовать эту технологию и полностью секвенировать и завершить геном, ученым Abbott пришлось разработать и применить новые методики, помогающие сузить вирусную часть образца.
В партнерстве с центрами крови, больницами и научно-исследовательскими институтами, на сегодняшний день Abbott собрала более 78 000 образцов, содержащих вирусы гепатита и ВИЧ, из 45 стран; идентифицировала и описала более 5 000 штаммов, а также опубликовала 125 исследовательских работ, призванных помочь научному сообществу узнать больше об этих вирусах.